阿巴嘎旗地处内蒙古高原东部，地势总体由东向西倾斜。海拔960—1500米。地貌类型有低山、丘陵、高平原、熔岩台地和沙地。由于处于中纬度西风带，属于温带半干旱大陆性气候，四季分明，各具特色。春天较短，大多晴空万里。冬天较长，茫茫草原被冰雪覆盖，银装素裹分外妖娆。夏季则凉爽宜人，蓝天白云，鸟语花香。秋季秋高气爽，天高云淡。

　　全旗境内有大小湖泊100多个，有利用价值的较大的湖泊12个，泉水83处。最大的湖泊是呼尔查干诺尔，位于阿巴嘎旗别力古台镇西南60公里，面积为109.63平方公里，是内蒙古自治区四大淡水湖之一，也是锡林郭勒盟最重要的渔业生产基地。

　　阿巴嘎旗植被属于半干旱草原类型，具有代表性的草原全是大针茅草原和克氏茅草原 。除南部沙地外，在全旗各地均有分布，形成典型的草原风光。南部沙地属浑善达克山地的一部分，期间沙丘起伏，生长着沙蒿、小黄柳和其他沙生植物，山丘地下水位较高，形成沙泉、小湖和沼泽。整个沙地景观完全不是人们想象中寸草不生的大漠，它水草丰美，风光秀丽，加之少有外界人为因素影响，更显得幽静雅致，颇有“塞外江南”之风，“沙漠花园”之美，而又不失北方大漠的粗矿与豪迈。

　　全旗共有野生植物426种，其中药用植物就有200多种，较名贵的有蒙古黄芷、麻黄、柴胡，防风、黄芩、知母、沙参，芍药和黄精等。更值得一提的是还有阿巴嘎旗特产食用菌和食用植物，纯天然无污染的绿色食用食品。食用菌主要有白蘑、黑蘑、黄盖子蘑；食用植物主要有黄花，山韭菜、沙葱，发菜等，是馈赠亲朋好友的最佳礼品。

　　阿巴嘎旗资源丰富，历史悠久，发展潜力巨大，后发优势明显，是个充满商机的宝地。主要矿产有铁、铜、煤、石油、莹石、石膏等20余种，具有埋藏浅、储量大、品位高等特点，开发利用前景广阔。已查明煤炭储量103.86亿吨，石灰岩3.6亿吨，萤石421.46万吨，钼40.85万吨，铅、锌62.526万吨，铁511.94万吨，主石膏11.47万吨，花岗岩104.88万立方米。全境风能、太阳能资源较为丰富，平均风速3.5米/秒，70米高度平均风速为8.9米/秒。年有效发电时间为2800小时。全年平均日照时数为3034.7小时，年总辐射量为5967北焦/平方米。地表水资源集中，地下水3.95亿立方米，查干淖尔湖总储水量约7000万立方米，水量由巴音河补给。